药学院历史悠久，是贵州中医药大学最早设立的系部之一。1975年设立中药系，1994年更名为药学系，2012年更名为药学院。现有教职工203人，其中博士124人、高级职称78人。拥有中药学、中药制药、中草药栽培与鉴定、中药资源与开发、药学、药物制剂、制药工程、生物制药、食品质量与安全共九个专业。我校于1974年成立中药学学科，1978年开设本科专业，1983年获国务院学位办首批中药学硕士研究生授予权，2007年中药学、药物制剂获批国家级特色专业；2012年中药学成为国家重点培育学科，2014年“卓越中药师培养计划”获批省级人才培养模式创新试点，2017年中药学获批贵州省国内一流建设学科和一流建设专业，同年12月通过教育部专业认证，2020年中药学专业获批国家教育部一流专业建设点；药学、药物制剂、中草药栽培与鉴定、中药制药、制药工程五个专业获国家教育部批准为省级一流专业建设点。目前优势专业中药学已形成学士、硕士、博士（联合培养）完整的人才培养体系。通过近五十年的发展，药学院在教学改革、人才培养、师资队伍、平台建设、科学研究、社会服务等领域实现了质的突破和飞跃，立足贵州，发挥智力、人才和资源优势，已成为贵州中药民族药和大健康产业发展的中流砥柱。